Whole Genome Sequencing (WGS) merupakan teknologi terkini dalam bidang genomika yang digunakan untuk membaca seluruh urutan DNA dari organisme. Teknologi ini telah berkembang dengan pesat dalam beberapa dekade terakhir dan banyak digunakan dalam bidang kesehatan. Pemanfaatan teknologi WGS untuk bidang kesehatan di Indonesia diimplementasikan melalui pendirian Biomedical and Genome Science Initiative (BGSi) berdasarkan KMK No. HK.01.07/MENKES/1141/2022 dan proyek genom manusia Indonesia. Namun, pemanfaatan data dan teknologi WGS di Indonesia masih menghadapi beberapa tantangan utama terkait belum adanya komite yang menangani penyelenggaraan WGS; terbatasnya infrastruktur laboratorium dan tenaga ahli genomika/bioinformatika; masih mahalnya biaya layanan WGS dan riset genomika; keterbatasan infrastruktur digital dan belum adanya regulasi spesifik untuk manajemen informasi genomika; serta minimnya kesadaran masyarakat mengenai manfaat dan aplikasi teknologi ini untuk bidang kesehatan. Berdasarkan identifikasi masalah dan hasil analisis data, rekomendasi kebijakan yang dapat diberikan untuk mengoptimalkan pemanfaatan data dan teknologi WGS meliputi pembentukkan komite yang menangani penyelenggaraan WGS di Indonesia; pemerataan dan peningkatan kapasitas penyelenggara WGS serta pelatihan terhadap tenaga ahli terkait; standarisasi protokol pengujian serta analisis dan penyimpanan data; perancangan skema subsidi dengan BPJS untuk meringankan biaya layanan WGS; peningkatan kapasitas penyimpanan data dan pembuatan regulasi yang ketat dalam pemanfaatan data genomika; serta mengadakan program literasi genomika nasional untuk meningkatkan partisipasi aktif masyarakat dalam program ini. Dengan demikian, policy brief ini diharapkan dapat mendorong pemanfaatan data dan teknologi WGS untuk pengembangan penelitian medis berbasis genomika dan precision medicine di Indonesia dalam upaya meningkatkan kesehatan nasional.